ภูมิคุ้มกันของร่างกายเริ่มที่ลำไส้
ปัจจุบันมีงานวิจัยสนับสนุนว่า จุลินทรีย์ในทางเดินอาหาร (gut microbiota) ซึ่งพบมากในลำไส้เล็กและลำไส้ใหญ่นั้น มีบทบาทสำคัญต่อการทำงานของระบบต่างๆ ในร่างกาย ทั้งการย่อยอาหารและดูดซึมสารอาหารที่ร่างกายมนุษย์ไม่สามารถย่อยได้ ช่วยส่งเสริมการทำงานของระบบภูมิคุ้มกันของร่างกาย ช่วยป้องกันการติดเชื้อก่อโรคในลำไส้ และช่วยสร้างวิตามินเค1
จุลินทรีย์ในร่างกายที่พบในลำไส้ ทางเดินอาหาร และสมอง มีการสื่อสารระหว่างกันผ่านทางระบบประสาท ฮอร์โมน ระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายจากโปรตีนที่หลั่งจากเซลล์ต่างๆ ในระบบภูมิคุ้มกัน2 การสร้างและการสลาย (เมแทบอไลต์) ของจุลินทรีย์ และการเสียสมดุลของจุลินทรีย์ นอกจากจะทำให้การทำงานของระบบทางเดินอาหารผิดปกติและลำไส้แปรปรวนแล้ว ยังพบว่าอาจส่งผลต่อระบบภูมิคุ้มกันของร่างกาย และอาจส่งผลให้เกิดโรคต่าง ๆ เช่น โรควิตกกังวล โรคซึมเศร้า โรคอ้วน โรคเบาหวานชนิดที่ 2 และโรคอัลไซเมอร์ด้วย3